Thông tư này quy định trình tự, thủ tục xét tài trợ, đặt hàng, thẩm định, phê duyệt tổ chức chủ trì, kinh phí và ký hợp đồng thực hiện nhiệm vụ nghiên cứu và phát triển công nghệ chiến lược (sau đây viết tắt là nhiệm vụ phát triển công nghệ chiến lược) thuộc Chương trình khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo quốc gia đặc biệt về công nghệ chiến lược quy định tại khoản 4, khoản 5 và khoản 6 Điều 7 Nghị định số 260/2026/NĐ-CP ngày 30/6/2026 của Chính phủ quy định chi tiết và biện pháp thi hành một số điều của Luật Công nghệ cao (sau đây viết tắt là Nghị định số 260/2026/NĐ-CP).

    Thông tư áp dụng đối với cơ quan quản lý nhà nước, tổ chức, doanh nghiệp, cá nhân Việt Nam, người Việt Nam định cư ở nước ngoài, tổ chức nước ngoài, cá nhân nước ngoài tham gia hoặc có liên quan đến việc xét tài trợ, đặt hàng và ký hợp đồng thực hiện nhiệm vụ phát triển công nghệ chiến lược thuộc Chương trình khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo quốc gia đặc biệt về công nghệ chiến lược (sau đây viết tắt là Chương trình quốc gia đặc biệt).

    Thông tư quy định yêu cầu, tiêu chí đối với các loại hình nhiệm vụ phát triển công nghệ chiến lược: Nhiệm vụ phát triển công nghệ chiến lược đặt hàng phải đáp ứng các yêu cầu quy định tại Điều 6 Thông tư số 42/2026/TT-BKHCN ngày 1/7/2026 của Bộ trưởng Bộ Khoa học và Công nghệ quy định trình tự, thủ tục xây dựng, thẩm định, phê duyệt nhiệm vụ nghiên cứu và phát triển công nghệ chiến lược đặt hàng thuộc Chương trình khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo quốc gia đặc biệt về công nghệ chiến lược. Nhiệm vụ phát triển công nghệ chiến lược tài trợ do tổ chức, doanh nghiệp, cá nhân đăng ký chủ trì  phải phù hợp với nội dung thông báo kế hoạch tài trợ nhiệm vụ phát triển công nghệ chiến lược thuộc Chương trình quốc gia đặc biệt do Bộ Khoa học và Công nghệ ban hành theo quy định tại khoản 1 Điều 8 Thông tư này và đáp ứng các yêu cầu quy định tại Điều 6 Thông tư số 42/2026/TT-BKHCN.

    Đồng thời, Thông tư cũng quy định nội dung gói công việc và mốc đánh giá: Nhiệm vụ phát triển công nghệ chiến lược bao gồm một hoặc nhiều gói công việc để thực hiện các mục tiêu của nhiệm vụ. Gói công việc được mô tả, xác định bao gồm các nội dung chính sau đây: tên; mục tiêu; công việc; kết quả đầu ra hoặc sản phẩm gắn với chỉ tiêu kỹ thuật; tiến độ thực hiện; cá nhân chủ trì; kinh phí thực hiện; mối liên hệ với các gói công việc khác (nếu có). Gói công việc được ký hiệu là WPi, trong đó i là số thứ tự của gói công việc. Nhiệm vụ phát triển công nghệ chiến lược bao gồm một hoặc nhiều mốc đánh giá. Mốc đánh giá được xác định, mô tả bao gồm các nội dung chính sau đây: thời điểm đánh giá; gói công việc hoặc các gói công việc được đánh giá; kết quả đầu ra hoặc sản phẩm gắn với chỉ tiêu kỹ thuật phải hoàn thành của từng gói công việc trong mốc đánh giá; kinh phí tương ứng với mốc đánh giá. Thời điểm đánh giá tại mốc là thời điểm dự kiến hoàn thành gói công việc hoặc gói công việc cuối cùng thuộc mốc đánh giá đó.

    Điểm xuyên suốt của cơ chế mới là chuyển từ quản lý chi phí đầu vào sang quản trị theo gói công việc, mốc đánh giá và kết quả đầu ra; trao quyền tự chủ cao hơn cho tổ chức thực hiện đi đôi với trách nhiệm giải trình; đồng thời tạo khuôn khổ tài chính phù hợp hơn với tính bất định của hoạt động nghiên cứu, phát triển công nghệ và bảo đảm quản lý chặt chẽ, hiệu quả nguồn lực ngân sách nhà nước.

    Thông tư số 48/2026/TT-BKHCN là một bước cụ thể hóa các chủ trương lớn của Đảng và Nhà nước về phát triển khoa học, công nghệ, đổi mới sáng tạo, chuyển đổi số và công nghệ chiến lược.

    Nghị quyết Đại hội XIV của Đảng xác định khoa học, công nghệ, đổi mới sáng tạo và chuyển đổi số quốc gia là động lực chính của mô hình tăng trưởng mới; đồng thời đặt ra yêu cầu khẩn trương hoàn thiện cơ chế, chính sách phát triển khoa học, công nghệ và các ngành mũi nhọn phù hợp với nguyên tắc thị trường, chuẩn mực và thông lệ quốc tế; có chính sách vượt trội đối với lao động sáng tạo, thu hút và trọng dụng nhân tài.

    Đặc biệt, Nghị quyết số 57-NQ/TW của Bộ Chính trị xác định thể chế, nhân lực, hạ tầng, dữ liệu và công nghệ chiến lược là những nội dung trọng tâm, cốt lõi, trong đó thể chế phải đi trước một bước; ưu tiên nguồn lực quốc gia cho khoa học, công nghệ, đổi mới sáng tạo và chuyển đổi số; từng bước tự chủ về công nghệ, nhất là công nghệ chiến lược.

    Nghị quyết 57-NQ/TW đồng thời đặt ra yêu cầu có cơ chế đặc thù để thu hút, trọng dụng và giữ chân nhà khoa học đầu ngành, chuyên gia và các “Tổng công trình sư” trong và ngoài nước có khả năng tổ chức, điều hành và triển khai các nhiệm vụ trọng điểm quốc gia.

    Trên tinh thần đó, Thông tư số 48/2026/TT-BKHCN cụ thể hóa chủ trương bằng những cơ chế tài chính có thể triển khai ngay trong thực tiễn như trả thù lao theo vị trí công việc; thuê chuyên gia theo cơ chế thị trường; quản lý kinh phí theo gói công việc và mốc đánh giá; khoán chi theo kết quả; tăng quyền tự chủ; huy động nguồn lực ngoài ngân sách; bố trí kinh phí dự phòng; triển khai nhiều phương án nghiên cứu độc lập và xử lý tài chính đối với rủi ro được chấp nhận.

Một trong những thay đổi nổi bật nhất là cơ chế chi trả thù lao cho nhân lực thực hiện nhiệm vụ công nghệ chiến lược. Thay vì chủ yếu dựa trên chức danh hành chính hoặc ngày công, thù lao được xác định theo vị trí công việc, yêu cầu chuyên môn, trách nhiệm, thời gian tham gia và sản phẩm đầu ra. Tổ chức chủ trì được chủ động xác định vị trí công việc phù hợp với từng gói công việc và yêu cầu thực tế của nhiệm vụ.

Thông tư số 48/2026/TT-BKHCN gồm 4 chương, 24 điều và có hiệu lực thi hành kể từ ngày 01/8/ 2026. Trường hợp văn bản quy phạm pháp luật được viện dẫn tại Thông tư này được sửa đổi, bổ sung hoặc thay thế thì áp dụng theo văn bản sửa đổi, bổ sung hoặc thay thế. Bãi bỏ một số nội dung quy định tại Thông tư số 36/2025/TT-BKHCN ngày 26 /11/2025 của Bộ trưởng Bộ Khoa học và Công nghệ quy định khung về trình tự, thủ tục xây dựng, thẩm định, ban hành, quản lý, tổ chức thực hiện chương trình khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo và quy định về trình tự, thủ tục xét tài trợ, đặt hàng, ký hợp đồng, tổ chức thực hiện, chấm dứt thực hiện, thanh lý hợp đồng giao nhiệm vụ và đánh giá đối với nhiệm vụ khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo. Bãi bỏ một số nội dung quy định tại Thông tư số 44/2025/TT-BKHCN ngày 30/11/2025 của Bộ trưởng Bộ Khoa học và Công nghệ quy định quản lý nhiệm vụ khoa học và công nghệ do Bộ Khoa học và Công nghệ tài trợ, đặt hàng.

    Đối với các đề xuất nhiệm vụ nghiên cứu phát triển công nghệ định hướng công nghệ chiến lược được gửi tới Quỹ Phát triển khoa học và công nghệ Quốc gia theo thông báo tài trợ được ban hành trước thời điểm Thông tư này có hiệu lực, việc xét tài trợ thực hiện theo quy định tại Thông tư số 44/2025/TT-BKHCN./.